Les zones humides occupent 2.6 % du territoire du Parc, avec une prédominance en Limousin où le terrain est imperméable. Mais attention, ces milieux régressent avec l'abandon des pratiques traditionnelles et la création d'étangs.

L’eau est omniprésente dans le Parc. En tête de trois bassins versants, de nombreuses rivières y prennent leur source. Ce sont elles qui ont donné naissance aux multiples zones humides, et qui alimentent la majorité des mares et étangs du territoire.

Outre sa grande diversité biologique,le Parc naturel régional du Périgord-Limousin abrite un patrimoine géologique exceptionnel avec un cratère de météorite aux alentours de Rochechouart où affleurent des roches spécifiques appelées impactites mais aussi des filons d’or, de quartz, de serpentine…...